第三季开篇，莉莉安学院迎来了一位性格叛逆的混血转学生艾米莉。她不认同学院里“妹妹必须服从姐姐”的传统，甚至公开拒绝了学生会会长、白蔷薇大人的结盟邀请。与此同时，前几季中已经毕业的学姐们因百年校庆回归，揭开了学院创始人曾是日本早期女权运动家的秘密。本季着重描写了三对“姐妹”关系的破裂与重生：志摩子必须面对妹妹即将毕业的孤独，佑巳在学生会工作中逐渐迷失了自我，而艾米莉的出现像一把尖刀，划开了这所看似完美的学园表面下的虚伪与压抑。在一次学园祭的即兴戏剧表演中，所有人终于喊出了那句压抑已久的“我想做自己的姐姐”。
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这一季不再仅仅是甜甜的友情，而是深入探讨了制度与个性之间的冲突。画风更加精美，音乐依然动人。艾米莉这个角色太有魅力了，她的直率打碎了那座象牙塔。
